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La Collezione di Anatomia Comparata complessivamente è costituita da oltre 9.000 pezzi che la rendono, nel suo genere, una delle più note a livello internazionale sia per l’entità sia per la rarità dei materiali. Attualmente sono esposti circa 2.500 preparati suddivisi in tre percorsi. Il primo, a carattere sperimentale e primo in Italia, è stato allestito nel 1988. Questo percorso è costituito da una serie di preparati che possono essere osservati ma anche toccati corredati da didascalie anche in braille permettendo la fruizione del percorso anche ai non vedenti. I pezzi di questo percorso consentono di sviluppare alcuni temi evolutivi come la modificazione dei denti in rapporto all’alimentazione. Il secondo percorso è focalizzato sull’evoluzione e sulle principali caratteristiche anatomiche dei vertebrati. Il terzo percorso è un itinerario didattico dedicato soprattutto agli studenti universitari e mantiene intatto il carattere originario della raccolta.